高纯氢可用于石油精炼、浮法玻璃、电子、食品、化工生产、航天、汽车业等行业。主要用于核研究、氘核加速器的轰击粒子、示踪剂、可以做气相色谱氢焰化验原料。在一般情况下，氢极易与氧结合。这种特性使其成为天然的还原剂使用于防止出现氧化的生产中。在玻璃制造的高温加工过程及电子微芯片的制造中，在氮气保护气中加入氢以去除残余的氧。氢的另一个重要的用途是对人造黄油、食用油、洗发精、润滑剂、家庭清洁剂及其它产品中的脂肪氢化。由于氢的高燃料性，航天工业使用液氢作为燃料。